安徽中醫(yī)學(xué)院創(chuàng)建于1959年，其前身為1952年7月在蕪湖開(kāi)設(shè)的安徽省中醫(yī)進(jìn)修班(1953年9月更名安徽中醫(yī)進(jìn)修學(xué)校)。

學(xué)校是國(guó)家中醫(yī)臨床研究基地建設(shè)單位，國(guó)家新增博士學(xué)位授權(quán)立項(xiàng)建設(shè)單位，國(guó)家中醫(yī)藥國(guó)際合作基地、碩士研究生免試推薦單位。 2005年，學(xué)校在國(guó)家教育部本科教學(xué)工作水平評(píng)估中取得優(yōu)良成績(jī)；2006年，在安徽省大學(xué)生思想政治教育工作評(píng)估中獲得優(yōu)秀成績(jī)；2007年，獲“全國(guó)廠（校）務(wù)公開(kāi)先進(jìn)單位”。是安徽省第七、八屆文明單位。 學(xué)校占地總面積328畝，分東、西兩個(gè)校區(qū)?，F(xiàn)有在校全日制本專科生9000余人、碩士生600余人、留學(xué)生77人、成教生近2000人。學(xué)?，F(xiàn)有教職工2000余人（含兩所附院），具有教授等高級(jí)職稱者135人，副教授等副高職稱者271人，講席教授2人，博士生導(dǎo)師10人，碩士生導(dǎo)師183人，享受政府津貼27人，博士80余人。另有30名國(guó)內(nèi)外知名專家學(xué)者應(yīng)聘擔(dān)任學(xué)?？妥淌?。

學(xué)校現(xiàn)有18個(gè)碩士點(diǎn)、 5個(gè)博士生聯(lián)合培養(yǎng)基地、26個(gè)本科專業(yè)（方向）。有12個(gè)二級(jí)教學(xué)院部、2所直屬附院、4所非直屬附院、10個(gè)中醫(yī)藥研究所。中醫(yī)學(xué)、中藥學(xué)、針灸推拿學(xué)為國(guó)家教育部高等學(xué)校特色專業(yè)、中醫(yī)內(nèi)科學(xué)為國(guó)家中醫(yī)藥管理局重點(diǎn)建設(shè)學(xué)科。學(xué)校還有1個(gè)安徽省A類重點(diǎn)學(xué)科、7個(gè)安徽省B類重點(diǎn)學(xué)科、9個(gè)國(guó)家中醫(yī)藥管理局重點(diǎn)建設(shè)?？啤?span lang="EN-US">5個(gè)省級(jí)重點(diǎn)?？啤?span lang="EN-US">9個(gè)省級(jí)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室及工程研究中心、4個(gè)省級(jí)教改示范專業(yè)、3個(gè)省級(jí)基礎(chǔ)課實(shí)驗(yàn)教學(xué)示范中心、6門(mén)省級(jí)重點(diǎn)課程、16門(mén)省級(jí)精品課程。

學(xué)校具有較強(qiáng)的科研實(shí)力和水平，新安醫(yī)學(xué)科技創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)、現(xiàn)代中藥研發(fā)產(chǎn)業(yè)創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)、內(nèi)科氣虛病證中醫(yī)藥調(diào)控的基礎(chǔ)及應(yīng)用研究創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)，均為省級(jí)創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)。“十五”以來(lái)，學(xué)校共承擔(dān)國(guó)家“973”、國(guó)家自然科學(xué)基金等各級(jí)各類項(xiàng)目600余項(xiàng)，科研經(jīng)費(fèi)5000余萬(wàn)元，獲研究成果200余項(xiàng)。學(xué)校已與黃山、亳州、寧國(guó)、績(jī)溪等十余個(gè)市縣政府，三九藥業(yè)、康緣藥業(yè)、宛西制藥、聯(lián)邦制藥、濟(jì)人藥業(yè)等一大批省內(nèi)外大型企業(yè)，建立了戰(zhàn)略合作關(guān)系。是安徽省產(chǎn)學(xué)研工作先進(jìn)單位。

1995年，學(xué)校獲準(zhǔn)招收國(guó)外留學(xué)生，2001年，開(kāi)始招收碩士學(xué)位國(guó)外留學(xué)生。已與美國(guó)、加拿大、丹麥、澳大利亞等19個(gè)國(guó)家和地區(qū)的30多個(gè)醫(yī)療和教育機(jī)構(gòu)建立了友好合作關(guān)系。

50年來(lái)，學(xué)校秉承安徽“北華佗、南新安”的醫(yī)學(xué)傳統(tǒng)，形成了“弘揚(yáng)新安醫(yī)學(xué)，培育中醫(yī)人才”的辦學(xué)特色，確立了“至精至誠(chéng)、惟是惟新”的辦學(xué)理念，在中醫(yī)藥學(xué)科建設(shè)、中醫(yī)藥人才培養(yǎng)、中醫(yī)藥對(duì)外交流、中醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)開(kāi)發(fā)與利用等方面，形成了獨(dú)特的優(yōu)勢(shì)，為國(guó)家培養(yǎng)了2萬(wàn)多名中醫(yī)藥高級(jí)人才。