醫(yī)學(xué)技術(shù)系前身為第三臨床醫(yī)學(xué)系，成立于2009年9月，2015年3月11日第三臨床醫(yī)學(xué)系更名為“醫(yī)學(xué)技術(shù)系”。醫(yī)學(xué)技術(shù)系下設(shè)系辦公室和系學(xué)生工作辦公室，分管醫(yī)學(xué)影像技術(shù)、醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)技術(shù)、醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)技術(shù)、眼視光學(xué)等四個(gè)專業(yè)以及臨床技術(shù)實(shí)驗(yàn)中心、臨床醫(yī)學(xué)概論教研室、醫(yī)學(xué)影像技術(shù)、醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)技術(shù)、醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)技術(shù)等專業(yè)教研室。

系主任黃金龍教授于1983年8月從昆明醫(yī)學(xué)院醫(yī)療系臨床醫(yī)學(xué)專業(yè)大學(xué)本科畢業(yè)，曾在云南省衛(wèi)生廳科教處，云南省醫(yī)學(xué)情報(bào)研究所工作，繼后在昆明醫(yī)科大學(xué)所屬的附一院和附四院從事呼吸內(nèi)科的疾病診斷和治療以及教學(xué)管理工作30余年，在國(guó)內(nèi)外重要學(xué)術(shù)刊物上發(fā)表論文共5篇，承擔(dān)過(guò)多項(xiàng)重要教學(xué)科研項(xiàng)目，其中1項(xiàng)為省部級(jí)項(xiàng)目，目前承擔(dān)著海源學(xué)院3項(xiàng)教學(xué)科研項(xiàng)目。

目前醫(yī)學(xué)技術(shù)系擁有二十四家醫(yī)院作為醫(yī)學(xué)影像技術(shù)、醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)技術(shù)、醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)技術(shù)專業(yè)的畢業(yè)生實(shí)習(xí)基地：即昆明醫(yī)科大學(xué)所屬的附一、附二、附三、附四、附五、附六院、附屬甘美醫(yī)院、附屬延安醫(yī)院、附屬曲靖醫(yī)院、云南省第一人民醫(yī)院、成都軍區(qū)昆明解放軍總醫(yī)院、昆明市第三人民醫(yī)院、曲靖市第二人民醫(yī)院、西雙版納州人民醫(yī)院、文山州人民醫(yī)院、昭通市第一人民醫(yī)院、紅河州第一人民醫(yī)院、開遠(yuǎn)市人民醫(yī)院、蒙自市人民醫(yī)院、彌勒市人民醫(yī)院、瀘西縣人民醫(yī)院、富民縣人民醫(yī)院、石林天奇醫(yī)院、昆明同仁醫(yī)院。我系學(xué)生畢業(yè)雙證獲得率為99%以上，就業(yè)率在93%以上。