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學(xué)院前身為中國人民解放軍第一軍醫(yī)大學(xué)政治理論教研室。2004年8月，按照國務(wù)院、中央軍委命令，第一軍醫(yī)大學(xué)整體移交廣東省，更名為南方醫(yī)科大學(xué)，第一軍醫(yī)大學(xué)政教室遂更名為南方醫(yī)科大學(xué)人文社會科學(xué)學(xué)院。2008年7月，獨(dú)立設(shè)置了馬克思主義學(xué)院。曾被評為全軍教書育人先進(jìn)單位，榮立集體三等功2次，多次被評為學(xué)校標(biāo)兵單位和先進(jìn)集體。

學(xué)院現(xiàn)有專任教師36名，其中具有高級職稱16人，碩士生導(dǎo)師10人，具有博學(xué)位的老師16人，博士后科研人員3人。擁有全軍和解放軍總后勤部優(yōu)秀教師8人，獲全軍育才獎金獎2人、銀獎3人，獲南粵優(yōu)秀教師2人，獲廣東省高校思想政治理論課名教師2人、名教師和骨干教師培養(yǎng)對象各1人。擁有廣東省宣傳思想戰(zhàn)線優(yōu)秀人才“十百千工程”培養(yǎng)對象3人，校級教學(xué)名師4人。擁有廣東省高校思想政治理論課教學(xué)指導(dǎo)委員會副主任委員1人、委員1人，有6人次擔(dān)任廣東省馬克思主義學(xué)會、社會學(xué)會、精神文明學(xué)會、科學(xué)社會主義學(xué)會副會長及廣東省哲學(xué)學(xué)會、中共黨史學(xué)會常務(wù)理事等學(xué)術(shù)職務(wù)。

學(xué)院設(shè)有馬克思主義原理、中國化馬克思主義概論等6教研室和思想政治教育、醫(yī)學(xué)/生命倫理等5個研究中心。學(xué)院擁有獨(dú)立的信息資料室，有圖書、期刊及影像資料5.2萬余冊。學(xué)院承擔(dān)全校各層次各專業(yè)的思想政治理論課教學(xué)與課程建設(shè)、馬克思主義理論學(xué)科建設(shè)與學(xué)術(shù)研究、思想政治理論課教師隊(duì)伍建設(shè)和馬克思主義理論專業(yè)碩士研究生培養(yǎng)等任務(wù)。

學(xué)院教師致力于以科研促教學(xué)，先后承擔(dān)和參與國家、軍隊(duì)和?。ú浚┘壙蒲姓n題20余項(xiàng)、承擔(dān)教學(xué)改革課題12項(xiàng)，獲軍隊(duì)和?。ú浚┘壙蒲信c教學(xué)成果獎勵26項(xiàng)，其中獲全軍教學(xué)優(yōu)秀成果一等獎1項(xiàng)。公開發(fā)表科研論文500余篇，其中多篇文章在《哲學(xué)研究》、《馬克思主義研究》、《近現(xiàn)代史研究》、《黨建研究》、《求是》雜志、《光明日報》等有重要影響的刊物上發(fā)表或轉(zhuǎn)載。在紅旗出版社、人民出版社、中國社會科學(xué)出版社、軍事科學(xué)出版社等國家級出版社出版專著、教材15部。

學(xué)院秉承人民軍隊(duì)高度重視思想政治理論課教學(xué)和課程質(zhì)量建設(shè)的優(yōu)良傳統(tǒng)。堅持以創(chuàng)新教學(xué)模式為重點(diǎn)，以精品和優(yōu)質(zhì)課建設(shè)為龍頭，課程建設(shè)取得了顯著成效。擁有省級精品資源課程1門，省級優(yōu)質(zhì)課程4門，校級精品課程5門，擁有廣東省高校毛澤東思想和中國特色社會主義理論體系概論教學(xué)研究基地和廣東省大學(xué)生思想政治教育社會實(shí)踐教學(xué)基地各1項(xiàng)。在2008年廣東省高校思想政治理論建設(shè)專項(xiàng)評估中獲得優(yōu)秀成績。

學(xué)院擁有馬克思主義理論一級學(xué)科碩士學(xué)位授予權(quán)。歷經(jīng)積淀，學(xué)科建設(shè)在馬克思主義中國化理論與實(shí)踐的發(fā)展，馬克思主義基本原理在當(dāng)代中國的運(yùn)用與發(fā)展，思想政治教育與醫(yī)學(xué)倫理教育的融合，中國近現(xiàn)代發(fā)展觀與民族精神的培育等領(lǐng)域，形成了穩(wěn)定的研究方向和鮮明的特色。為培養(yǎng)德智體美全面發(fā)展、具有系統(tǒng)的馬克思主義理論素養(yǎng)和堅定信仰、能夠勝任科學(xué)研究、高等教育和思想政治工作的高層次專業(yè)人才，奠定了堅實(shí)基礎(chǔ)。目前，學(xué)院在馬克思主義原理、馬克思主義發(fā)展史、國外馬克思主義研究、中國化馬克思主義研究、思想政治教育研究、中國近現(xiàn)代史基本問題研究等6個二級學(xué)科專業(yè)方向，面向全國招收3年制學(xué)術(shù)型研究生。