1957年8月，學(xué)校經(jīng)國家批準(zhǔn)開設(shè)業(yè)余大學(xué)，開始成人教育工作，當(dāng)年即舉辦五年制醫(yī)療專科班，1964年9月停辦。1984年9月恢復(fù)成人教育招生（夜大形式），隸屬學(xué)校教務(wù)處。1990年成立成人教育處。1992年4月，在原夜大學(xué)和成人教育處的基礎(chǔ)上成立成人教育學(xué)院，開始招收脫產(chǎn)、半脫產(chǎn)、函授和夜大等學(xué)歷形式學(xué)生。2005年10月，為適應(yīng)醫(yī)學(xué)繼續(xù)教育發(fā)展，擴(kuò)大醫(yī)學(xué)成人高等教育服務(wù)外延，進(jìn)一步拓展新的工作領(lǐng)域，成立繼續(xù)教育學(xué)院，與成人教育學(xué)院合并辦公。2018年底，學(xué)校賦予學(xué)院新的職能，形成高等學(xué)歷繼續(xù)教育、同等學(xué)力人員申請碩士學(xué)位、在職醫(yī)師申請臨床醫(yī)學(xué)博士專業(yè)學(xué)位一體化培養(yǎng)的格局。

2019年7月18日，經(jīng)校黨委常委會(huì)研究決定，撤銷原繼續(xù)教育學(xué)院黨總支，成立繼續(xù)教育學(xué)院直屬黨支部。學(xué)院現(xiàn)下設(shè)黨政辦公室、招生與社會(huì)培訓(xùn)管理辦公室、教學(xué)管理辦公室、考試與評價(jià)中心、學(xué)生與學(xué)籍管理辦公室、非學(xué)歷教育管理辦公室。在附屬阜陽醫(yī)院設(shè)立分校，在安慶醫(yī)藥高等?？茖W(xué)校、黃山職業(yè)技術(shù)學(xué)院、安徽省淮北衛(wèi)生學(xué)校設(shè)立教學(xué)點(diǎn)。目前在籍各層次各專業(yè)共有學(xué)生近兩萬人，包含在職醫(yī)師申請臨床醫(yī)學(xué)博士專業(yè)學(xué)位、以研究生同等學(xué)力申請碩士學(xué)位、成人高等教育專升本三個(gè)層次。多年來，學(xué)院堅(jiān)持貫徹黨的教育方針，堅(jiān)持立德樹人根本任務(wù)，累計(jì)為社會(huì)培養(yǎng)各層次醫(yī)療健康衛(wèi)生人才近10萬人，為促進(jìn)地區(qū)衛(wèi)生健康事業(yè)發(fā)展做出了突出貢獻(xiàn)，獲得社會(huì)廣泛的贊譽(yù)和信賴。

習(xí)近平總書記在十九大報(bào)告中提出“辦好繼續(xù)教育，加快建設(shè)學(xué)習(xí)型社會(huì)，大力提高國民素質(zhì)”。校第八次黨代會(huì)提出支持繼續(xù)發(fā)展，穩(wěn)步擴(kuò)大繼續(xù)教育辦學(xué)規(guī)模的目標(biāo)要求，將繼續(xù)教育高質(zhì)量發(fā)展納入學(xué)校高質(zhì)量人才統(tǒng)一培養(yǎng)范疇。面向未來，學(xué)院將高舉習(xí)近平新時(shí)代中國特色社會(huì)主義思想偉大旗幟，全面貫徹黨的繼續(xù)教育方針，堅(jiān)持為黨育人、為國育才，堅(jiān)定不移貫徹“兩個(gè)堅(jiān)持”實(shí)現(xiàn)“兩個(gè)更大”目標(biāo)要求，內(nèi)強(qiáng)綜合改革，大力開展線上教育教學(xué)，形成“學(xué)院—職能科室—培養(yǎng)單位（教學(xué)點(diǎn)）—年級主任—班主任”五級網(wǎng)格化管理體制，著力推進(jìn)治理能力和治理體系現(xiàn)代化；外強(qiáng)合作辦學(xué)，充分利用社會(huì)資源和力量，著力拓展繼續(xù)發(fā)展空間。貫徹新發(fā)展理念，開拓創(chuàng)新，積極作為，打造繼續(xù)教育高質(zhì)量發(fā)展新局面，為學(xué)校奮力開創(chuàng)國內(nèi)一流高水平醫(yī)科大學(xué)建設(shè)新局面不懈努力！