學院前身是成立于1922年的原東南大學農(nóng)科的土壤門（專業(yè)），1952年原中央大學農(nóng)業(yè)化學系、金陵大學土壤組和浙江大學農(nóng)學院農(nóng)業(yè)化學系的一部分合并組建南京農(nóng)學院土壤農(nóng)業(yè)化學系，1996年更名為資源與環(huán)境科學學院，是我國最早具有碩士、博士學位授予權單位之一。學院畢業(yè)生中涌現(xiàn)了中科院院士、中國工程院院士等一批國內(nèi)外著名的學者和省部級、廳局級、校（所）長等優(yōu)秀領導者。

全院現(xiàn)有教職工172人，其中教授57人，副教授44人，擁有“國家千人計劃專家”、“國家杰出青年基金獲得者”、“國家教學名師”、“全國農(nóng)業(yè)科研杰出人才”、“全國師德標兵”、國務院學位委員會學科評議組召集人、全國優(yōu)秀博士論文獲得者等杰出人才和教育部、農(nóng)業(yè)部、江蘇省的科研創(chuàng)新團隊。

學院擁有農(nóng)業(yè)資源與環(huán)境、環(huán)境科學與工程、生態(tài)學三個一級學科，學科排名處于ESI國際生態(tài)環(huán)境領域前1%。其中，農(nóng)業(yè)資源與環(huán)境學科為國家一級重點學科、“985優(yōu)勢學科創(chuàng)新平臺”重點建設學科和江蘇省重點建設的A 類（優(yōu)秀）優(yōu)勢學科；在教育部學位中心組織的第三次和第四次全國一級學科評估中分別名列全國第一和A+；入選最新公布的世界“雙一流”建設學科。學院設有農(nóng)業(yè)資源與環(huán)境、生態(tài)學2個博士后流動站、4個本科專業(yè)，年招收研究生約300名（其中博士生60多名），本科生約200名。農(nóng)業(yè)資源與環(huán)境專業(yè)為教育部特色專業(yè)，江蘇省品牌專業(yè)；環(huán)境工程專業(yè)為江蘇省品牌專業(yè)，并通過了中國工程教育認證專業(yè)協(xié)會組織的環(huán)境工程教育專業(yè)認證；環(huán)境科學專業(yè)為校品牌專業(yè)；同時學院與中國科學院聯(lián)合設立“資源環(huán)境科學菁英班”。學院教學中心被評為“江蘇省實驗教學省級示范中心”。學院獨立設有黃瑞采教授獎學金和十多個企業(yè)獎助學金，年資助在校生近百萬元。

國際交流方面，目前學院已與美、英等國家和地區(qū)的數(shù)十所著名高校和研究所建立了合作關系，設有教育部、國家外專局“農(nóng)業(yè)資源與環(huán)境學科生物學研究創(chuàng)新引智基地”。學院科研實力雄厚，擁有2個國家工程中心、5個省部級重點實驗室和工程中心。近五年來作為第一完成單位獲國家科技進步二等獎、國家技術發(fā)明二等獎、國家教學成果二等獎等，承擔著一批國家和地方部門的重大科研項目，年到位科研經(jīng)費約9000萬元，年發(fā)表SCI論文200余篇。

學院今年繼續(xù)實行大類招生，招生專業(yè)為環(huán)境科學與工程類，學生在第3學期進行專業(yè)分流，分流為現(xiàn)有的農(nóng)業(yè)資源與環(huán)境、環(huán)境科學、環(huán)境工程、生態(tài)學四個本科專業(yè)。