云南中醫(yī)藥大學(xué)第二臨床醫(yī)學(xué)院前身為針灸推拿康復(fù)學(xué)院，是學(xué)校下設(shè)的二級(jí)教學(xué)科研單位，2020 年 7 月與第二附屬醫(yī)院實(shí)施了“院院合一“的改革，是醫(yī)教協(xié)同深度融合而成的綜合性特色學(xué)院。目前實(shí)行云南中醫(yī)藥大學(xué)第二臨床醫(yī)學(xué)院、針灸推拿康復(fù)學(xué)院、第二附屬醫(yī)院和云南省血栓病醫(yī)院“四塊牌子一套班子”的管理體制和運(yùn)行機(jī)制。

目前承辦針灸推拿學(xué)、康復(fù)治療學(xué)、中醫(yī)康復(fù)學(xué)和中醫(yī)養(yǎng)生學(xué)四個(gè)專(zhuān)業(yè)，針灸推拿學(xué)專(zhuān)業(yè)為云南省省級(jí)一流專(zhuān)業(yè)、省級(jí)特色建設(shè)專(zhuān)業(yè)和省級(jí)綜合改革試點(diǎn)專(zhuān)業(yè)。推拿學(xué)為國(guó)家中醫(yī)藥管理局“十二五”中醫(yī)藥重點(diǎn)學(xué)科，針灸學(xué)為云南省省級(jí)重點(diǎn)學(xué)科。針灸推拿學(xué)專(zhuān)業(yè)為碩士、博士學(xué)位授權(quán)點(diǎn)，中西醫(yī)結(jié)合康復(fù)學(xué)專(zhuān)業(yè)為碩士學(xué)位授權(quán)點(diǎn)。有本科、碩士、2個(gè)辦學(xué)層次。

學(xué)院內(nèi)設(shè)5個(gè)職能科室，即黨政辦公室、教學(xué)管理辦公室、學(xué)生工作辦公室、科研及學(xué)科管理辦公室和一個(gè)針灸推拿康復(fù)研究所。有 8個(gè)教研室即針灸基礎(chǔ)教研室、針灸臨床教研室、實(shí)驗(yàn)針灸教研室、推拿基礎(chǔ)教研室、推拿臨床教研室、康復(fù)治療教研室、中醫(yī)康復(fù)教研室和中醫(yī)養(yǎng)生教研室。

現(xiàn)有教編專(zhuān)任教師57人，醫(yī)療編制員工427人，正高23人，副高69人，博士17人，碩士58人。享受云南省特殊津貼專(zhuān)家1人，云南省名中醫(yī)3人，博士生導(dǎo)師2人，碩士生導(dǎo)師52人。在校學(xué)生2143名，其中本科生1902名，全日制碩士研究生、博士研究生241名。

借助云南省高校針灸推拿防治腦病重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、云南省高校針灸防治神志病創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)、云南省科技廳朱勉生專(zhuān)家工作站和梁繁榮專(zhuān)家工作站等科研平臺(tái)，近5年新增國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目9項(xiàng)，省部級(jí)課題10余項(xiàng)，形成了醫(yī)教研協(xié)同，本、碩、博聯(lián)動(dòng)的人才培養(yǎng)體系。