農(nóng)學院前身為1958年成立的內(nèi)蒙古農(nóng)牧學院農(nóng)學系。1988年原農(nóng)學系分設為農(nóng)學系和園藝系，1999年由原內(nèi)蒙古農(nóng)牧學院農(nóng)學系、園藝系和原內(nèi)蒙古林學院植物生理、植物遺傳育種、植物保護教研室合并組建成為現(xiàn)在的農(nóng)學院，2019年農(nóng)學院分設為農(nóng)學院和園藝植保學院，是學校組建院（系）早、辦學規(guī)模大的學院之一。學院現(xiàn)有教職員工56人，其中教授14人，副教授15人，高級實驗師2人，已取得博士學位的30人，其中有2人入選自治區(qū)新世紀“321”人才工程，5人入選自治區(qū)教育廳“111”人才工程；3人被評為自治區(qū)有突出貢獻中青年專家、深入生產(chǎn)一線突出貢獻人員，6人被評為自治區(qū)“草原英才”，特聘院士2人。學院設有農(nóng)學、植物科學與技術、種子科學與工程3個本科專業(yè)。設有作物學一級學科博士學位授權點（自治區(qū)重點一級學科），作物栽培學與耕作學（自治區(qū)重點學科）、作物遺傳育種（自治區(qū)重點學科）、植物學（理學）3個二級學科博士學位授權點。設有作物學一級學科和植物學、作物栽培學與耕作學、作物遺傳育種、種子科學與技術4個二級學科碩士學位授權點。學院有作物學、生物學2個博士后科研流動站，設有“內(nèi)蒙古自治區(qū)作物栽培與遺傳改良重點實驗室”1個。