南京農(nóng)業(yè)大學(xué)金融學(xué)院的發(fā)展歷史可上溯至20世紀(jì)初期。1921年秋，金陵大學(xué)設(shè)立我國(guó)第一個(gè)農(nóng)業(yè)經(jīng)濟(jì)學(xué)系，卜凱教授開始從事農(nóng)業(yè)保險(xiǎn)方面的調(diào)查研究。1929年秋，中央大學(xué)農(nóng)學(xué)院設(shè)立農(nóng)政科，開設(shè)農(nóng)村金融等課程。1952年，金陵大學(xué)農(nóng)學(xué)院、南京大學(xué)農(nóng)學(xué)院和浙江大學(xué)農(nóng)學(xué)院部分系科合并成立南京農(nóng)學(xué)院，下設(shè)農(nóng)業(yè)經(jīng)濟(jì)系等。1984年，南京農(nóng)學(xué)院更名為南京農(nóng)業(yè)大學(xué)，農(nóng)業(yè)經(jīng)濟(jì)系增設(shè)農(nóng)村金融專業(yè)，同年開始招收農(nóng)村金融和會(huì)計(jì)審計(jì)方向碩士研究生，1985年開始招收金融學(xué)專業(yè)本科生，1998年取得金融學(xué)碩士學(xué)位授予權(quán)，2002年開始招收農(nóng)村金融專業(yè)博士生，2004年取得會(huì)計(jì)學(xué)碩士學(xué)位授予權(quán)，2010年獲金融學(xué)博士學(xué)位授權(quán)點(diǎn)。2012年10月，成立南京農(nóng)業(yè)大學(xué)金融學(xué)院。

金融學(xué)院現(xiàn)有金融學(xué)、會(huì)計(jì)學(xué)和投資學(xué)三個(gè)本科專業(yè)。其中，2006年金融學(xué)專業(yè)列為江蘇省品牌專業(yè)，2010年會(huì)計(jì)學(xué)專業(yè)列為江蘇省特色專業(yè)，2012年金融學(xué)專業(yè)和會(huì)計(jì)學(xué)專業(yè)又成為江蘇省重點(diǎn)建設(shè)專業(yè)。

金融學(xué)院目前擁有金融學(xué)博士、金融學(xué)碩士、會(huì)計(jì)學(xué)碩士、金融碩士（MF）、會(huì)計(jì)碩士（MPAcc）等多層次的研究生培養(yǎng)體系，為中國(guó)農(nóng)業(yè)銀行總行、中國(guó)人民銀行南京分行等舉辦金融學(xué)碩士班，為政府有關(guān)部門、銀行、保險(xiǎn)公司、證券公司、會(huì)計(jì)師事務(wù)所等培養(yǎng)了眾多高層次的金融、會(huì)計(jì)和審計(jì)方面的專業(yè)人才。

金融學(xué)院現(xiàn)有專職教師及研究人員40多名，其中教授11人，副教授13人，博士生導(dǎo)師8人，碩士生導(dǎo)師25人，具有博士學(xué)位教師占90.3%，擁有海外學(xué)習(xí)經(jīng)歷教師占32.2%。學(xué)院擁有江蘇省“青藍(lán)工程”中青年學(xué)術(shù)帶頭人1人，江蘇省“333”工程培養(yǎng)對(duì)象1人、江蘇省“青藍(lán)工程”優(yōu)秀青年骨干教師1人，南京農(nóng)業(yè)大學(xué)“鐘山學(xué)術(shù)新秀”培養(yǎng)對(duì)象3人，學(xué)院具有較高的教學(xué)水平和研究能力。學(xué)院目前共有重點(diǎn)共建基地14家，包括中國(guó)銀行江蘇省分行、中國(guó)郵儲(chǔ)銀行南京分行、中國(guó)民生銀行、江蘇銀行、紫金農(nóng)商銀行、淮安農(nóng)商銀行、蘇寧銀行、蘇寧集團(tuán)、畢馬威會(huì)計(jì)師事務(wù)所等。

金融學(xué)院教師依托江蘇省高校哲學(xué)社會(huì)重點(diǎn)研究基地——江蘇省農(nóng)村金融發(fā)展研究中心、南京農(nóng)業(yè)大學(xué)中國(guó)金融和區(qū)域經(jīng)濟(jì)研究中心、南京農(nóng)業(yè)大學(xué)財(cái)政金融研究所、南京農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)業(yè)保險(xiǎn)研究所等研究平臺(tái)開展研究工作。近年來，本院教師主持國(guó)家社科基金重大項(xiàng)目、國(guó)家社科基金重點(diǎn)項(xiàng)目、國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目、國(guó)家社科基金一般項(xiàng)目、教育部、農(nóng)業(yè)部、世界銀行等國(guó)家級(jí)、省部級(jí)和國(guó)際合作課題90多項(xiàng)，在Journal of the Operational Research Society、《管理世界》、《金融研究》、《會(huì)計(jì)研究》等國(guó)內(nèi)外高水平專業(yè)期刊上發(fā)表研究論文300余篇，獲得省部級(jí)等各種獎(jiǎng)勵(lì)30多項(xiàng)。