南京農(nóng)業(yè)大學(xué)信息科技學(xué)院可追溯至1981年成立的計算中心和1985年籌建的農(nóng)業(yè)圖書情報專業(yè)。1987年設(shè)立了農(nóng)業(yè)圖書情報系，1993 年農(nóng)業(yè)圖書情報系更名為信息管理系，本科專業(yè)名稱也于1999年更名為信息管理與信息系統(tǒng)專業(yè)。2000年計算機(jī)科學(xué)與技術(shù)本科專業(yè)開始招生。2001年，信息管理系和計算中心合并成立信息科學(xué)技術(shù)學(xué)院。目前，信息科學(xué)技術(shù)學(xué)院下設(shè)計算機(jī)科學(xué)與技術(shù)系、信息管理系及計算機(jī)與信息技術(shù)實驗中心。

經(jīng)過30多年的辦學(xué)歷程及建院10多年的發(fā)展，學(xué)院已由20世紀(jì)80年代中期單一的本科教育發(fā)展成為現(xiàn)在的本、碩、博多層次培養(yǎng)體系相結(jié)合的專業(yè)教育體系。目前的信息科學(xué)技術(shù)學(xué)院共有計算機(jī)科學(xué)與技術(shù)、網(wǎng)絡(luò)工程、信息管理與信息系統(tǒng)三個本科專業(yè)；圖書情報與檔案管理一級學(xué)科博士點；計算機(jī)科學(xué)與技術(shù)、圖書情報與檔案管理兩個一級學(xué)科碩士點；農(nóng)業(yè)碩士（農(nóng)業(yè)信息化領(lǐng)域）、圖書情報碩士兩個專業(yè)學(xué)位碩士點，擁有各層次全日制在校生800余人。其中，信息管理與信息系統(tǒng)專業(yè)為江蘇省特色專業(yè)，計算機(jī)科學(xué)與技術(shù)專業(yè)為校級特色專業(yè)，江蘇省卓越工程師計劃（軟件類）專業(yè)，情報學(xué)二級學(xué)科點為校級重點學(xué)科。此外，學(xué)院具有良好的實驗設(shè)施和教學(xué)科研環(huán)境，建有資料室、公共教學(xué)實驗室及各類專業(yè)教學(xué)實驗室。計算機(jī)與實驗設(shè)備總量達(dá)800余臺（套），價值1000多萬元，能夠為學(xué)生的實踐教學(xué)和教師科研活動提供良好的環(huán)境和必要的保障。

信息科學(xué)技術(shù)學(xué)院現(xiàn)有教職員工55人，其中專職教師41人，教授7人，副教授23人，具有高級職稱的教師占學(xué)院教師總數(shù)的73.17%以上，具有博士學(xué)位的教師占學(xué)院教師總數(shù)的75.61%，多名教師具有一年以上歐美知名大學(xué)訪學(xué)經(jīng)歷。4位教師入選江蘇省“青藍(lán)工程”優(yōu)秀青年骨干教師，1位教師入選江蘇省“333高層次人才培養(yǎng)工程”第二層次，1位教師入選江蘇省“333高層次人才培養(yǎng)工程”第三層次，4位教師入選南京農(nóng)業(yè)大學(xué)“鐘山學(xué)術(shù)新秀”。學(xué)院教師承擔(dān)過包括國家級重大、重點項目在內(nèi)的一系列國家級、省部級項目，在科研及社會服務(wù)方面取得了豐碩的成果。