南京農(nóng)業(yè)大學動物醫(yī)學院的前身為1921年創(chuàng)立的東南大學（后改名為中央大學）畜牧獸醫(yī)系，是我國最早成立的畜牧獸醫(yī)系之一。學院學科實力一流，享有較高的國際聲譽。現(xiàn)為全國獸醫(yī)專業(yè)學位教育指導委員會秘書處掛靠單位。擁有一級學科國家重點學科獸醫(yī)學，覆蓋預防獸醫(yī)學、臨床獸醫(yī)學、基礎(chǔ)獸醫(yī)學3個二級學科國家重點學科。在90多年的辦學歷程中，一大批我國獸醫(yī)學科奠基人和開拓者在本院任教，已為國家培養(yǎng)了7000多名畢業(yè)生，其中有一批知名學者、企業(yè)家和省市級領(lǐng)導干部。學院現(xiàn)每年招收本科生185人，全日制碩士、博士研究生230人。

動物醫(yī)學院建有豬鏈球菌OIE國際參考實驗室、“動物健康與食品安全”國際合作聯(lián)合實驗室、動物科學類國家級教學示范中心3個國家級教學科研平臺，另設(shè)有5個省部級重點實驗室和研究中心。設(shè)動物醫(yī)學、動物藥學兩個本科專業(yè)及金善寶實驗班（動物生產(chǎn)類）。其中動物醫(yī)學專業(yè)2005年被評為江蘇省品牌專業(yè)，2008年被評為教育部特色專業(yè)，2012年被評為江蘇省重點專業(yè)，2014年被評為卓越農(nóng)林人才計劃建設(shè)專業(yè)。人才培養(yǎng)質(zhì)量國內(nèi)領(lǐng)先，獲國家級教學成果二等獎1項，省級教學成果一等獎1項，擁有3門國家級精品課程。學院獨立設(shè)立了院級獎學金二十余項，學生獲獎率超過40%。

學院師資力量雄厚，現(xiàn)有教職員工128人，其中正高職稱45人，副高職稱26人。博士生指導教師38名，碩士生指導教師66名。教師中擁有國務院學位委員會獸醫(yī)學科評議組成員、國家萬人計劃專家、長江學者、國家杰出青年基金獲得者、省部級突出貢獻的中青年專家、教育部跨（新）世紀優(yōu)秀人才和江蘇省特聘教授等一大批杰出人才。

動物醫(yī)學院承擔大量國家及部省級科研項目。近五年，科研經(jīng)費達2億多元， SCI收錄刊物發(fā)表論文700余篇，獲國家發(fā)明專利授權(quán)近百項?！柏i鏈球菌病研究及防控技術(shù)”獲國家科技進步二等獎。

學院重視國際合作和學術(shù)交流，先后與國外30多所知名高校和科研院所建立了合作關(guān)系。在人才培養(yǎng)方面，與美國加州大學戴維斯分校獸醫(yī)學院聯(lián)合開辦國際高端獸醫(yī)繼續(xù)教育課程，與美國加州大學戴維斯分校、美國愛荷華州立大學簽訂了“4+2”聯(lián)合培養(yǎng)項目。學院每年招收國外全日制留學生20多人。此外，先后為全球留學生舉辦了近20期國際獸醫(yī)針灸與中藥培訓班。