2000年8月成立應用數(shù)學系，2014年7月撤系建院。學院下設數(shù)學與應用數(shù)學和信息與計算數(shù)學兩個本科專業(yè)，數(shù)學與應用數(shù)學專業(yè)下設財經(jīng)數(shù)學實驗班。學院現(xiàn)擁有數(shù)學（一級學科）碩士學位點，涵蓋基礎(chǔ)數(shù)學、應用數(shù)學與計算科學、概率論與數(shù)理金融、最優(yōu)化與控制等二級學科；還擁有“應用概率”博士點。目前建有計算數(shù)學實驗室和數(shù)學建模實驗室，2016年成立了“計算科學與金融大數(shù)據(jù)研究中心”，緊扣前沿，針對金融海量數(shù)據(jù)進行建模與計算創(chuàng)新研究。

數(shù)學學院師資力量雄厚，近兩年年數(shù)學學院先后引進數(shù)學學科帶頭人4名，現(xiàn)有專職教師53人，其中教授16人，副教授18人，具有博士學位的教師46人，博士生導師8人，碩士生導師26人，大部分教師具有國外留學、進修或訪學經(jīng)歷。師資隊伍擁有國家自然科學基金評審組專家、新世紀百千萬人才工程國家級人選、上海市浦江人才、曙光學者、上海市科技進步獎、湯森路透“高被引科學家”、上海市教委晨光計劃等；另外也擁有數(shù)學類專業(yè)教學指導委員會委員、中國數(shù)學會副理事長、中國數(shù)學會高等教育委員會主任委員，有全國優(yōu)秀教師、省級教學名師，教學團隊也獲得過國家級和省部級教學成果獎多項。近五年，數(shù)學學院教師在SCI收錄雜志和權(quán)威A、B期刊上發(fā)表論文150余篇，由數(shù)學學院教師主持并立項的國家自然科學基金項目15項，教育部、上海市教委創(chuàng)新和浦江人才計劃項目7項，主編并出版教材、著作10余本。

數(shù)學學院負責我校學生參加國內(nèi)外數(shù)學建模競賽和數(shù)學競賽的組織、指導與培訓工作。近三年，全校學生積極參加全國和美國大學生數(shù)學建模競賽，取得了優(yōu)異成績，共獲得全國一等獎3個，美賽特等獎2個，特等獎提名2個，在上海市名列前茅。近三年，學校有5名學生進入全國大學生數(shù)學競賽決賽，其中3人獲全國一等獎，1人獲全國二等獎，1人獲全國三等獎。近三年我校學生在上海市大學生數(shù)學競賽中屢創(chuàng)佳績，獲獎比例全市名列前茅，共獲得各類獎項144項。

數(shù)學學院的畢業(yè)生具備深厚的數(shù)學基礎(chǔ)知識，同時掌握經(jīng)濟、金融、管理等應用科學的相關(guān)內(nèi)容。一方面，深受用人單位青睞；另一方面，隨著學院教學改革的深入，形成了良好的學風，升學率也逐年攀升。2017、2018年學院國內(nèi)外升學率分別為55.26%、66.03%。多位同學進入復旦大學，北京大學、上海交大、中國人民大學金融、經(jīng)濟、數(shù)學、統(tǒng)計、信息等專業(yè)深造。

自2014年起，學院本科生按數(shù)學大類招生，新生入校時不分專業(yè)。本科生培養(yǎng)分為大類培養(yǎng)和專業(yè)培養(yǎng)兩個階段，第一、二學年為大類培養(yǎng)階段，后兩年分專業(yè)培養(yǎng)。從2017級新生入校時，按照拔尖人才培養(yǎng)要求，設立財經(jīng)數(shù)學實驗班。