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北京師范大學(xué)本科生團(tuán)隊(duì)BNU-China再獲國際遺傳工程機(jī)器大賽金獎
美國波士頓時(shí)間11月22日14:00,國際遺傳工程機(jī)器大賽(International Genetically Engineered Machine Competition, iGEM)落下帷幕。由北京師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院2018級本科生陳翊苓擔(dān)任隊(duì)長,余依盈、鄢冉擔(dān)任副隊(duì)長,來自生命科學(xué)學(xué)院、勵耘學(xué)院、數(shù)學(xué)科學(xué)學(xué)院、人工智能學(xué)院、藝術(shù)與傳媒學(xué)院等院系的31名同學(xué)組成的北京師范大學(xué)本科生團(tuán)隊(duì)BNU-China克服疫情帶來的巨大困難,再次斬獲金牌。這是BNU-China團(tuán)隊(duì)建隊(duì)七年來第四次獲得金牌,保持了BNU-China團(tuán)隊(duì)一貫的高水平。
iGEM競賽是合成生物學(xué)領(lǐng)域的國際頂級學(xué)術(shù)性競賽,由美國麻省理工學(xué)院于2003年發(fā)起,是一項(xiàng)以合成生物學(xué)為核心,綜合生命科學(xué)、數(shù)學(xué)、工程學(xué)、信息科學(xué)、藝術(shù)設(shè)計(jì)等多個(gè)學(xué)科的國際大賽,受到Nature、Science、Scientific American、Economists 等學(xué)術(shù)期刊,以及 BBC 等媒體的廣泛關(guān)注和專題報(bào)道。iGEM鼓勵世界各地的優(yōu)秀學(xué)生不斷創(chuàng)新,通過合成生物學(xué)手段解決社會關(guān)注和科技前沿問題;同時(shí)致力于創(chuàng)造一個(gè)國際性的合成生物學(xué)社群,為未來的領(lǐng)域精英提供交流和展示平臺。很多世界一流大學(xué)將這項(xiàng)賽事作為教學(xué)改革的重要引擎,著力培養(yǎng)跨學(xué)科、創(chuàng)新型,綜合能力強(qiáng)、具有領(lǐng)導(dǎo)力的未來科技領(lǐng)軍人才。生命科學(xué)學(xué)院依托高水平國際學(xué)科競賽,改革創(chuàng)新、不斷優(yōu)化人才培養(yǎng)模式,促進(jìn)拔尖人才培養(yǎng)質(zhì)量提升。今年,iGEM吸引了來自全球包括哈佛大學(xué)、麻省理工大學(xué)等世界頂級名校在內(nèi)的256支隊(duì)伍參賽。自2014年開始參與iGEM至今的七年時(shí)間里,BNU-China獲得了四金、兩銀、一銅的好成績。
2020年,BNU-China的項(xiàng)目Automatic Barcode Creator(ABC)利用今年諾貝爾化學(xué)獎獲獎的基因編輯CRISPR / Cas9系統(tǒng),建立在群體細(xì)胞中對個(gè)體細(xì)胞進(jìn)行譜系追蹤的DNA條形碼(barcode)新技術(shù)。CRISPR / Cas9會在DNA條形碼上引入隨機(jī)突變,細(xì)胞在生長分化過程中獲得特異的條形碼,通過序列分析,可以區(qū)分個(gè)體細(xì)胞并追蹤并繪制細(xì)胞譜系樹。
使用CLB2啟動子和降解標(biāo)簽來控制Cas9的作用時(shí)間,從而使Cas9與細(xì)胞分裂相偶聯(lián)并自動標(biāo)記每個(gè)細(xì)胞。 為了提高條形碼的多樣性,使用了可以重復(fù)切割的homing guide RNA(hgRNA)來代替single guide RNA(sgRNA)。 考慮到實(shí)際應(yīng)用,將該技術(shù)與單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序相結(jié)合,通過雙啟動子使得從轉(zhuǎn)錄組信息中獲得譜系信息成為可能。BNU-China所建立的ABC系統(tǒng)推陳出新,可以幫助科研人員更好地進(jìn)行譜系追蹤,在腫瘤發(fā)生、干細(xì)胞治療、器官移植、胚胎發(fā)育和微生物突變株的篩選等多個(gè)領(lǐng)域均可能應(yīng)用。
受疫情影響,BNU-China團(tuán)隊(duì)的實(shí)驗(yàn)時(shí)間被最大程度的壓縮。但在這種情況下,BNU-China團(tuán)隊(duì)仍堅(jiān)持在未能返校時(shí)通過大量查閱文獻(xiàn)、建模、與相關(guān)教授和生物公司技術(shù)人員交流等方式來不斷完善設(shè)計(jì)與工作方案,并在返校后第一時(shí)間展開實(shí)驗(yàn)。BNU-China團(tuán)隊(duì)歷時(shí)8個(gè)多月,在生命科學(xué)學(xué)院朱旭東、楊冬、郝曉冉、陳金波、李森、向本瓊等多位教授專家指導(dǎo)下,完成文獻(xiàn)調(diào)研、方案設(shè)計(jì)、載體構(gòu)建、基因表達(dá)、數(shù)學(xué)建模、功能驗(yàn)證等工作,通過網(wǎng)頁、海報(bào)、推廣視頻以及視頻展示等,清晰完美的展現(xiàn)了創(chuàng)新工作成果,獲得了大賽評委的一致好評,最終促成了今年BNU-China再次獲得金牌的好成績。